Патогены вторичных инфекций у пациентов с сепсисом имеют такой же генотип, как микроорганизмы, обитающие в кишечнике

Mu et al. Critical Care (2022)

https://doi.org/10.1186/s13054-022-03943-z

Исследование

Перевод реферата оригинальной статьи «The pathogens of secondary infection in septic patients share a similar genotype to those that predominate in the gut»

Keywords: Sepsis, Gut microbiota, Bacterial translocation, Secondary nosocomial infection

Ключевые слова: сепсис, микробиота кишечника, транслокация бактерий, вторичная нозокоминальная инфекция

Введение: вторичные нозокомиальные инфекции, возбудителями которых в основном являются карбапенем-резистентная Klebsiella pneumoniae (CRKP) и ванкомицин-резистентный Enterococcus faecium (VRE), часто развиваются у пациентов с сепсисом. Это исследование имело своей целью выявление источника вторичных системных патогенов и обнаружение механизмов, лежащих в основе вторичной инфекции.

Методы: это проспективное обсервационное случай-контроль исследование, в которое включило в себя 34 пациента с сепсисом, 33 пациента без сепсиса, все проходили лечение в отделении интенсивной терапии (ОИТ) и 10 здоровых добровольцев, которые составили контрольную группу. Было получено триста двенадцать образцов кала, после чего проводилось секвенирование апликона гена 16S rRNA. Метагеномное секвенирование проводилось с целью выявления гомологии между доминированием CRKP или VRE в кишечнике и патогенов, выявленных в источниках вторичных инфекций. В качестве модели псевдомикробных животных использовали мышей C57/BL после предварительной обработки антибиотиками широкого спектра действия в течение двух недель.

Результаты: разнообразие и изобилие микробиоты кишечника у пациентов с сепсисом резко снижается в течение одной недели после поступления пациента в ОИТ, потенциально увеличивая возможности для роста бактерий, резистентных к антибиотикам. Более того, вторичные инфекции кровотока и абдоминальные инфекции у пациентов с сепсисом, вызываемые CRKP или VRE, возникали после колонизации кишечника преобладающими видами бактерий. Геномный анализ показал, что изоляты бактерий вторичных инфекций имеют высокую гомологичность с соответствующими и преобладающими в кишечнике условно-патогенными микроорганизмами. К тому же на животных моделях было показано, что введение антибиотиков вызывает преобладание CRKP и VRE в микробиоте кишечника, что увеличивает вероятность проникновения CRKP и VRE в другие ткани, вызывая в последующем системные инфекции у псевдомикробных мышей, что подтверждает нашу гипотезу.

Выводы: наше исследования показало, что источником патогенов, вызывающих вторичную инфекцию у пациентов с сепсисом, может быть колонизированный патогенами кишечник вследствие применения антибиотиков широкого спектра действия.